Quando potiamo un bonsai non dobbiamo dimenticare che deve utilizzare energie extra per la cicatrizzazione del taglio ed inoltre sono alterati i canali linfatici con conseguente riduzione di afflusso della linfa e maggiore perdita d' acqua, ma non solo, nelle ferite potrebbero insidiarsi dei parassiti o insetti lignicoli.
E' importante potare i bonsai quando sono forti e vigorosi, proteggere le ferite con mastici cicatrizzanti che favoriscono la cicatrizzazione impedendo infiltrazioni d'acqua e umidità e proteggendo dai patogeni.
Il bonsai reagisce al taglio quando si trova in fase vegetativa, per questa ragione il periodo indicato per la potatura è quello che precede il risveglio vegetativo (fine inverno) oppure poco prima del riposo invernale.
Nella zona colpita si formano dei tessuti che cicatrizzano la ferita, quindi un tessuto meristematico da cui si formano i tessuti della parte lesa, il meristema si unisce al cambio già presente formando il callo cicatrizzante.
Nelle grandi ferite il callo cicatrizzante è formato dal cambio cribro−legnoso dei bordi del taglio.